MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 15230

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022784	GCT	2	6	139032	139037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625395
1502	NC_022784	CT	3	6	139036	139041	0 %	50 %	0 %	50 %	557625395
1503	NC_022784	TCT	2	6	139093	139098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625395
1504	NC_022784	GTGC	2	8	139295	139302	0 %	25 %	50 %	25 %	557625396
1505	NC_022784	AGG	2	6	139350	139355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625396
1506	NC_022784	TCA	2	6	139416	139421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625396
1507	NC_022784	TGA	2	6	139438	139443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625396
1508	NC_022784	GT	3	6	139522	139527	0 %	50 %	50 %	0 %	557625396
1509	NC_022784	TGC	2	6	139597	139602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625396
1510	NC_022784	GTTGCA	2	12	139603	139614	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	557625396
1511	NC_022784	GAAT	2	8	139624	139631	50 %	25 %	25 %	0 %	557625396
1512	NC_022784	GCT	2	6	139688	139693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625396
1513	NC_022784	GCAG	2	8	139702	139709	25 %	0 %	50 %	25 %	557625396
1514	NC_022784	GCT	2	6	139721	139726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625396
1515	NC_022784	AGC	2	6	139728	139733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625396
1516	NC_022784	GAT	2	6	139763	139768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625396
1517	NC_022784	TGA	2	6	139798	139803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625396
1518	NC_022784	TGA	2	6	139822	139827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625396
1519	NC_022784	GAA	2	6	139829	139834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625396
1520	NC_022784	CGG	2	6	139940	139945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625397
1521	NC_022784	CTG	2	6	139966	139971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625397
1522	NC_022784	GAT	2	6	139974	139979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625397
1523	NC_022784	CTAA	2	8	140032	140039	50 %	25 %	0 %	25 %	557625397
1524	NC_022784	GCA	2	6	140063	140068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625397
1525	NC_022784	TAC	2	6	140071	140076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625397
1526	NC_022784	CAG	2	6	140188	140193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625397
1527	NC_022784	GGA	2	6	140251	140256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625397
1528	NC_022784	GGT	2	6	140294	140299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625397
1529	NC_022784	ATT	2	6	140392	140397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625397
1530	NC_022784	TTGC	2	8	140473	140480	0 %	50 %	25 %	25 %	557625397
1531	NC_022784	GCT	2	6	140516	140521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625397
1532	NC_022784	CCA	2	6	140558	140563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625397
1533	NC_022784	TGAC	2	8	140603	140610	25 %	25 %	25 %	25 %	557625397
1534	NC_022784	GAA	2	6	140614	140619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625397
1535	NC_022784	GCG	2	6	140686	140691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625397
1536	NC_022784	TGT	2	6	140802	140807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625397
1537	NC_022784	CGGG	2	8	140810	140817	0 %	0 %	75 %	25 %	557625397
1538	NC_022784	TCC	2	6	140881	140886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625397
1539	NC_022784	TG	3	6	140904	140909	0 %	50 %	50 %	0 %	557625397
1540	NC_022784	CAA	2	6	140910	140915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625397
1541	NC_022784	CTG	3	9	140975	140983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625397
1542	NC_022784	CG	3	6	140990	140995	0 %	0 %	50 %	50 %	557625397
1543	NC_022784	GTT	2	6	141043	141048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625397
1544	NC_022784	A	6	6	141071	141076	100 %	0 %	0 %	0 %	557625397
1545	NC_022784	GCG	2	6	141082	141087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625397
1546	NC_022784	TG	4	8	141150	141157	0 %	50 %	50 %	0 %	557625397
1547	NC_022784	CTC	2	6	141193	141198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557625397
1548	NC_022784	AAT	2	6	141430	141435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625398
1549	NC_022784	GAT	2	6	141545	141550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625398
1550	NC_022784	GCT	2	6	141583	141588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625398
1551	NC_022784	AT	3	6	141606	141611	50 %	50 %	0 %	0 %	557625398
1552	NC_022784	GCC	2	6	141614	141619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625398
1553	NC_022784	GCT	2	6	141656	141661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625398
1554	NC_022784	TA	3	6	141666	141671	50 %	50 %	0 %	0 %	557625398
1555	NC_022784	T	8	8	141811	141818	0 %	100 %	0 %	0 %	557625399
1556	NC_022784	GAGCT	2	10	141874	141883	20 %	20 %	40 %	20 %	557625399
1557	NC_022784	GTG	2	6	141885	141890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625399
1558	NC_022784	AT	3	6	141909	141914	50 %	50 %	0 %	0 %	557625399
1559	NC_022784	TCG	2	6	141922	141927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625399
1560	NC_022784	AAC	2	6	141983	141988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625399
1561	NC_022784	TGC	2	6	142000	142005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625399
1562	NC_022784	GTA	2	6	142021	142026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625399
1563	NC_022784	TA	3	6	142107	142112	50 %	50 %	0 %	0 %	557625399
1564	NC_022784	TTG	2	6	142141	142146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625399
1565	NC_022784	GTT	2	6	142148	142153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625399
1566	NC_022784	AGGC	2	8	142154	142161	25 %	0 %	50 %	25 %	557625399
1567	NC_022784	TC	3	6	142174	142179	0 %	50 %	0 %	50 %	557625399
1568	NC_022784	TC	3	6	142364	142369	0 %	50 %	0 %	50 %	557625399
1569	NC_022784	ATGG	2	8	142400	142407	25 %	25 %	50 %	0 %	557625399
1570	NC_022784	TC	3	6	142446	142451	0 %	50 %	0 %	50 %	557625399
1571	NC_022784	TCGT	2	8	142455	142462	0 %	50 %	25 %	25 %	557625399
1572	NC_022784	T	6	6	142462	142467	0 %	100 %	0 %	0 %	557625399
1573	NC_022784	GCC	2	6	142479	142484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625399
1574	NC_022784	GCC	2	6	142530	142535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625399
1575	NC_022784	TAC	2	6	142552	142557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625399
1576	NC_022784	TG	3	6	142599	142604	0 %	50 %	50 %	0 %	557625399
1577	NC_022784	TTC	2	6	142650	142655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625399
1578	NC_022784	AC	3	6	142672	142677	50 %	0 %	0 %	50 %	557625399
1579	NC_022784	GTG	2	6	142711	142716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625399
1580	NC_022784	AG	3	6	142717	142722	50 %	0 %	50 %	0 %	557625399
1581	NC_022784	ATG	2	6	142786	142791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625399
1582	NC_022784	CGCT	2	8	142854	142861	0 %	25 %	25 %	50 %	557625399
1583	NC_022784	GGA	2	6	142958	142963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625399
1584	NC_022784	GCG	2	6	142965	142970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625399
1585	NC_022784	AC	3	6	142997	143002	50 %	0 %	0 %	50 %	557625399
1586	NC_022784	AGC	2	6	143065	143070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625399
1587	NC_022784	GCAG	2	8	143165	143172	25 %	0 %	50 %	25 %	557625399
1588	NC_022784	TG	3	6	143176	143181	0 %	50 %	50 %	0 %	557625399
1589	NC_022784	GAC	2	6	143262	143267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625399
1590	NC_022784	ACTC	2	8	143296	143303	25 %	25 %	0 %	50 %	557625399
1591	NC_022784	GGC	2	6	143369	143374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625399
1592	NC_022784	GCCA	2	8	143411	143418	25 %	0 %	25 %	50 %	557625399
1593	NC_022784	G	6	6	143705	143710	0 %	0 %	100 %	0 %	557625400
1594	NC_022784	GT	4	8	143762	143769	0 %	50 %	50 %	0 %	557625400
1595	NC_022784	GCG	2	6	143823	143828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625400
1596	NC_022784	GTT	2	6	143946	143951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625400
1597	NC_022784	TGC	2	6	144068	144073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625400
1598	NC_022784	CAG	2	6	144114	144119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625400
1599	NC_022784	T	6	6	144141	144146	0 %	100 %	0 %	0 %	557625400
1600	NC_022784	TAA	2	6	144182	144187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625400
1601	NC_022784	GTT	2	6	144204	144209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625400
1602	NC_022784	TG	3	6	144220	144225	0 %	50 %	50 %	0 %	557625400
1603	NC_022784	CG	3	6	144246	144251	0 %	0 %	50 %	50 %	557625400
1604	NC_022784	GGT	2	6	144257	144262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625400
1605	NC_022784	TGG	2	6	144329	144334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625400
1606	NC_022784	TA	3	6	144401	144406	50 %	50 %	0 %	0 %	557625400
1607	NC_022784	GCT	2	6	144415	144420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625400
1608	NC_022784	TGA	2	6	144421	144426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625400
1609	NC_022784	CTG	2	6	144456	144461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625400
1610	NC_022784	GTT	2	6	144528	144533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625400
1611	NC_022784	GAA	2	6	144581	144586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625400
1612	NC_022784	AAAG	2	8	144633	144640	75 %	0 %	25 %	0 %	557625400
1613	NC_022784	TGGG	2	8	144733	144740	0 %	25 %	75 %	0 %	557625400
1614	NC_022784	TAT	2	6	144753	144758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557625400
1615	NC_022784	TAG	2	6	144790	144795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625400
1616	NC_022784	GGC	2	6	144818	144823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625400
1617	NC_022784	TGG	2	6	144877	144882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625400
1618	NC_022784	ATC	2	6	144918	144923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625400
1619	NC_022784	AGA	2	6	144950	144955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625400
1620	NC_022784	TCGT	2	8	144957	144964	0 %	50 %	25 %	25 %	557625400
1621	NC_022784	TTG	2	6	144973	144978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625400
1622	NC_022784	GCG	2	6	145065	145070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625400
1623	NC_022784	TGC	2	6	145210	145215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625400
1624	NC_022784	TGC	2	6	145241	145246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625400
1625	NC_022784	TGA	3	9	145298	145306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625400
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1629	NC_022784	GGT	2	6	145567	145572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625401
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1632	NC_022784	TGGA	2	8	145960	145967	25 %	25 %	50 %	0 %	557625401
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1643	NC_022784	GTT	2	6	146355	146360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625402
1644	NC_022784	TGA	2	6	146375	146380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625402
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1647	NC_022784	TG	3	6	146494	146499	0 %	50 %	50 %	0 %	557625402
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1665	NC_022784	GA	3	6	147829	147834	50 %	0 %	50 %	0 %	557625403
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1720	NC_022784	A	6	6	150618	150623	100 %	0 %	0 %	0 %	557625406
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1730	NC_022784	ACT	2	6	151357	151362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625407
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1733	NC_022784	AGT	2	6	151553	151558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625407
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1737	NC_022784	CG	3	6	151724	151729	0 %	0 %	50 %	50 %	557625407
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1740	NC_022784	CGG	2	6	152010	152015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625408
1741	NC_022784	GCT	2	6	152042	152047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557625408
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1743	NC_022784	ACC	2	6	152184	152189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625408
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1745	NC_022784	GTCT	2	8	152272	152279	0 %	50 %	25 %	25 %	557625408
1746	NC_022784	CGG	2	6	152359	152364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	557625408
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1751	NC_022784	T	6	6	152872	152877	0 %	100 %	0 %	0 %	557625408
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1786	NC_022784	T	6	6	160660	160665	0 %	100 %	0 %	0 %	557625411
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1836	NC_022784	T	6	6	163407	163412	0 %	100 %	0 %	0 %	557625414
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1855	NC_022784	TTGC	2	8	164933	164940	0 %	50 %	25 %	25 %	557625415
1856	NC_022784	CTTG	2	8	165016	165023	0 %	50 %	25 %	25 %	557625415
1857	NC_022784	CTA	2	6	165031	165036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625415
1858	NC_022784	TCT	2	6	165138	165143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625415
1859	NC_022784	TCA	2	6	165196	165201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625415
1860	NC_022784	TAC	2	6	165268	165273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557625415
1861	NC_022784	A	7	7	165325	165331	100 %	0 %	0 %	0 %	557625415
1862	NC_022784	GCA	2	6	165405	165410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557625415
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1864	NC_022784	T	6	6	165507	165512	0 %	100 %	0 %	0 %	557625415
1865	NC_022784	T	6	6	165519	165524	0 %	100 %	0 %	0 %	557625415
1866	NC_022784	CGC	2	6	165566	165571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557625415
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1872	NC_022784	CG	3	6	165868	165873	0 %	0 %	50 %	50 %	557625415
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1977	NC_022784	TGA	2	6	173193	173198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625421
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1979	NC_022784	AGCCA	2	10	173249	173258	40 %	0 %	20 %	40 %	557625421
1980	NC_022784	CG	3	6	173282	173287	0 %	0 %	50 %	50 %	557625421
1981	NC_022784	GGT	2	6	173350	173355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557625422
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1984	NC_022784	CAA	2	6	173518	173523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625422
1985	NC_022784	ACGC	2	8	173551	173558	25 %	0 %	25 %	50 %	557625422
1986	NC_022784	GAG	2	6	173560	173565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557625422
1987	NC_022784	GAA	2	6	173648	173653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557625422
1988	NC_022784	CCA	2	6	173677	173682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557625422
1989	NC_022784	AAT	2	6	173695	173700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625422
1990	NC_022784	ACA	2	6	173703	173708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557625422
1991	NC_022784	AAT	2	6	173810	173815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625422
1992	NC_022784	G	6	6	173816	173821	0 %	0 %	100 %	0 %	557625422
1993	NC_022784	AAT	2	6	173915	173920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557625422
1994	NC_022784	TCT	2	6	173960	173965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557625422
1995	NC_022784	GTT	2	6	173987	173992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625422
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1997	NC_022784	TGT	2	6	174101	174106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625422
1998	NC_022784	ATG	2	6	174399	174404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557625423
1999	NC_022784	GCTT	2	8	174421	174428	0 %	50 %	25 %	25 %	557625423
2000	NC_022784	TGT	2	6	174445	174450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557625423

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